Od wielu już lat jednym z priorytetów w pracy szkoły są różnorodne działania ekologiczne, które wyróżniają naszą placówkę spośród innych szkół gminy Myślenice. Działania te obejmowały zarówno edukację ekologiczną ( zajęcia przyrody, lekcje wychowawcze, ścieżka ekologiczna, program autorski dla klas I-III „Mały ekolog”, współpraca z ZUO – wycieczki w poszukiwaniu Ekolandii, współpraca z Nadleśnictwem Myślenice – wycieczki edukacyjne, przeprowadzenie inwentaryzacji dendrologicznej terenu zielonego wokół szkoły – zinwentaryzowano 245 szt., uczestnictwo w konkursach ekologicznych)  jaki praktyczne włączenie się w ochronę środowiska poprzez cykliczne zbiórki surowców wtórnych (makulatura, baterie, aluminium, tonery).

W roku szkolnym 2008/09 najważniejszymi działaniami w tym zakresie były:

• Przystąpienie do Programu „Szkoła dla ekorozwoju”- uzyskanie certyfikatu Lokalnego Centrum Aktywności Ekologicznej;
• Udział w gminnym konkursie „Każdy śmieć chce swoje miejsce mieć”;
• Udział klas IV w zajęciach edukacyjno- leśnych na Uklejnie;
• Włączenie się do projektu SOUSTENERGY – „Energia? Wiem wszystko” zajęcia  w wytypowanych klasach oraz monitorowanie temperatury w salach lekcyjnych;
• Współpraca z  MZWiK w Myślenicach –  udział warsztatach  „Kropla do kropli”   i w konkursie wiedzy o wodzie ;
• „Niebezpieczne odpady – baterie, tonery, świetlówki, leki” – zintensyfikowanie działań zmierzających do odzysku baterii i tonerów, akcja plakatowa;
• Włączenie się do ogólnopolskiego programu „Elekto – Eko” poprzez udział wytypowanych klas do projektu „Każdy uczeń wie co zrobić z ZSEE” oraz akcja plakatowa ;
• Realizacja przez klasę IId projektu „Kalejdoskop łąki i lasu, czyli co o bioróżnorodności każdy uczeń  powinien wiedzieć” –  NFOŚiG  i PKE;
• Udział w konkursach pozaszkolnych: „Mój las”, „Ekologiczna Małopolska”  i „Świat Ekologicznej Żywności”;
• Organizacja Świtowego Dnia Ochrony Środowiska – prezentacja pt. „Ekologiczna Dwójka” – program artystyczny i podsumowanie działań ekologicznych, rozdanie nagród.
• Podsumowanie akcji zbiórkowo-segregacyjnych w roku szkolnym 2008/09: 18548 kg makulatury, 120 kg baterii, 80 kg aluminium, ok. 450 szt. tonerów, 280k plastiku  i 616 kg szkła.

W prowadzonych od 2003 roku akcjach zbiórkowych zebrano ogółem: 81731 kg   makulatury, 779 kg baterii, ok. 1250 szt. tonerów.

We wrześniu 2009r. odebrano we Wrocławiu przyznany szkole Certyfikat Lokalnego Centrum Aktywności Ekologicznej. W powiecie myślenickim  taki certyfikat posiada tylko Gimnazjum Nr 1 w Myślenicach.

W I półroczu  roku szkolnego 2009/10 zebrano już 8450 kg makulatury,  100 kg baterii, 71 kg aluminium, 280 kg plastiku i 77 kg szkła;

Uczniowie szkoły   uzyskali także  I miejsce w gminnym konkursie „Kropla do kropli” oraz  dwa wyróżnienia w konkursie plastycznym na tzw. Ekobohatera. Nasi uczniowie brali udział  zajęciach poświęconych ekosystemowi lasu (we współpracy  z Nadleśnictwem Myślenice) oraz zapoznających z gatunkami zagrożonych ptaków ( we współpracy z NFOŚiGW).

W październiku 2009r. został wykonany bezpłatnie audyt środowiskowy szkoły przeprowadzony przez pracownika Politechniki Krakowskiej na zlecenie Fundacji Partnerstwa dla Środowiska przydzielającej certyfikaty ekologiczne dla szkół.

 Oprócz powyższych działań szkoła ustawicznie dba o edukację ekologiczną poprzez tworzenie programów autorskich  o charakterze innowacyjnym, prowadzenie zajęć tematycznych lekcyjnych i pozalekcyjnych. Działalność ekologiczna jest skorelowana   z edukacją prozdrowotną i regionalną.

Nasze działania ekologiczne to praktyczna edukacja na rzecz zrównoważonego rozwoju. Łącząc wiedzę o racjonalnym gospodarowaniu zasobami przyrodniczymi  i kulturowymi  z praktycznym jej zastosowaniem w skali lokalnej staramy się wychować czułych na problemy nie tylko swojego najbliższego środowiska młodych Myśleniczan.